Το μάθημα Βιομοριακές Προσομοιώσεις είναι ένα εξειδικευμένο διεπιστημονικό μάθημα που προσφέρει μια ολοκληρωμένη πρώτη εικόνα της κλασσικής Υπολογιστικής Χημείας/Βιολογίας. Στόχος του μαθήματος είναι η εμβάθυνση στη θεωρία και πρακτική των βιομοριακών προσομοιώσεων, με αποτέλεσμα την ποιοτική και ποσοτική κατανόηση κρίσιμων μικροσκοπικών μηχανισμών που συνδέονται με τη (δυσ)λειτουργία του κυττάρου αλλά και τη φαρμακευτική ανακάλυψη σε προκλινικό επίπεδο.

Το μάθημα προσφέρει στους σπουδαστές μια ολοκληρωμένη επισκόπηση των αρχών λειτουργίας και των εφαρμογών που προσφέρουν προηγμένες υπολογιστικές τεχνικές, επιτρέποντας τη μελέτη βιολογικών συστημάτων από τη σκοπιά της μικροσκοπικής δομής, θερμοδυναμικής και κινητική μεμονωμένων βιομορίων έως πιο περίπλοκες κυτταρικές διεργασίες, όπως αυτή της δημιουργίας υγροσταγονιδίων. Τέλος εξετάζει θεμελιώδη ζητήματα όπως τη σχέση μικροσκοπικών αλληλεπιδράσεων και μακροσκοπικών ιδιοτήτων, αλλά και τη γεφύρωση χρονικών και χωρικών κλιμάκων μέσω βιομοριακών προσομοιώσεων.