Τομέας Βοτανικής & Μικροβιολογίας
Ο Τομέας Βοτανικής και Μικροβιολογίας ιδρύθηκε το 2016 με το ΦΕΚ 2130/τ.Β’/11-07-2016. Περιλαμβάνει τέσσερα εργαστήρια:
- Εργαστήριο Γενικής και Γεωργικής Μικροβιολογίας
- Εργαστήριο Ηλεκτρονικής Μικροσκοπίας
- Εργαστήριο Συστηματικής Βοτανικής
- Εργαστήριο Φυσιολογίας και Μορφολογίας Φυτών
Ο Τομέας είναι υπεύθυνος για την κατεύθυνση του ΠΠΣ με τίτλο: ‘Εφαρμοσμένη Φυσιολογία Φυτών και Βιοτεχνολογία Μικροοργανισμών’ του 9ου εξαμήνου.
Στον Τομέα υπηρετούν δεκατρία μέλη Δ.Ε.Π., πέντε μέλη Ε.ΔΙ.Π. και ένα μέλος Ε.Τ.Ε.Π.
Εργαστήριο Γενικής & Γεωργικής Μικροβιολογίας
Το Εργαστήριο Γενικής και Γεωργικής Μικροβιολογίας ιδρύθηκε το 1973. Διευθυντής του Εργαστηρίου είναι ο Καθηγητής κ. Γεώργιος Ζερβάκης.
Το προσωπικό του Εργαστηρίου διδάσκει τα μαθήματα Γενική Μικροβιολογία, Βιοτεχνολογία Μικροοργανισμών, Μικροβιολογία Εδάφους, Μικροοργανισμοί και Αειφόρος Γεωργία, Αρχές Μοριακής Βιολογίας και Βιοχημεία. Τα ερευνητικά ενδιαφέροντα των μελών του εργαστηρίου αφορούν την περιβαλλοντική μικροβιολογία, τη μοριακή οικολογία μικροοργανισμών, τη βιοποικιλότητα, ταξινόμηση και φυλογενετική μικροοργανισμών, τη μυκητολογία, τις αλληλεπιδράσεις μικροοργανισμών και φυτών, τη γονιδιωματική, πρωτεομική και μεταβολομική των μικροοργανισμών, τη μοριακή βιολογία και φυσιολογία των μικροοργανισμών, τη βιοτεχνολογία μικροοργανισμών και την ανάπτυξη σχετικών εφαρμογών, την ολοκληρωμένη διαχείριση γεωργικών και αγροβιομηχανικών αποβλήτων, την καλλιέργεια μανιταριών κλπ
Προσωπικό
Ερευνητικά Προγράμματα Εργαστηρίου
NanoHybrid
BiO-FURious
Δημοσιεύσεις - Συνέδρια Εργαστηρίου
Εργαστήριο Ηλεκτρονικής Μικροσκοπίας
To εργαστήριο Ηλεκτρονικής Μικροσκοπίας ανήκει στον Τομέα Βοτανικής και Μικροβιολογίας
Προσωπικό
Ερευνητικά Προγράμματα Εργαστηρίου
Δημοσιεύσεις - Συνέδρια Εργαστηρίου
Sumbele S., Fotelli M.N., Nikolopoulos D., Tooulakou G., Liakoura V., Liakopoulos G., Bresta P., Dotsika E., Adams M.A., Karabourniotis G. Photosynthetic capacity is negatively correlated with the concentration of leaf phenolic compounds across a range of different species (2012) AoB PLANTS, 2012, 2012, pls025
Malounas I., Paliouras G., Nikolopoulos D., Liakopoulos G., Bresta P., Londra P., Katsileros A., Fountas S. Early detection of broccoli drought acclimation/stress in agricultural environments utilizing proximal hyperspectral imaging and AutoML (2024) Smart Agricultural Technology, 8, art. no. 100463
Nikolopoulos D., Bresta P., Daliani V., Haghiou V., Darra N., Liati M., Mavrogianni E., Papanastasiou A., Porfyraki T., Psaroudi V., Karabourniotis G., Liakopoulos G. Leaf anatomy affects optical properties and enhances photosynthetic performance under oblique light (2024) Plant Cell and Environment, 47 (5), pp. 1471 - 1485
Kolyva F., Nikolopoulos D., Bresta P., Liakopoulos G., Karabourniotis G., Rhizopoulou S. Acclimation of the Grapevine Vitis vinifera L. cv. Assyrtiko to Water Deficit: Coordination of Structural and Functional Leaf Traits and the Dynamic of Calcium Oxalate Crystals (2023) Plants, 12 (23), art. no. 3992
Vahamidis P., Stefopoulou A., Kotoulas V., Bresta P., Nikolopoulos D., Karabourniotis G., Mantonanakis G., Vlachos C., Dercas N., Economou G. Grain size variation in two-rowed malt barley under Mediterranean conditions: Phenotypic plasticity and relevant trade-offs (2022) Field Crops Research, 279, art. no. 108454
Roig-Oliver M., Bresta P., Nikolopoulos D., Bota J., Flexas J. Dynamic changes in cell wall composition of mature sunflower leaves under distinct water regimes affect photosynthesis (2021) Journal of Experimental Botany, 72 (22), pp. 7863 - 7875
Karabourniotis G., Liakopoulos G., Bresta P., Nikolopoulos D. The optical properties of leaf structural elements and their contribution to photosynthetic performance and photoprotection (2021) Plants, 10 (7), art. no. 1455
Roig-Oliver M., Bresta P., Nadal M., Liakopoulos G., Nikolopoulos D., Karabourniotis G., Bota J., Flexas J. Cell wall composition and thickness affect mesophyll conductance to CO2diffusion in Helianthus annuus under water deprivation (2020) Journal of Experimental Botany, 71 (22), pp. 7198 - 7209
Karabourniotis G., Horner H.T., Bresta P., Nikolopoulos D., Liakopoulos G. New insights into the functions of carbon–calcium inclusions in plants (2020) New Phytologist, 228 (3), pp. 845 - 854
Gómez-Espinoza O., González-Ramírez D., Bresta P., Karabourniotis G., Bravo L.A. Decomposition of calcium oxalate crystals in colobanthus quitensis under CO2 limiting conditions (2020) Plants, 9 (10), art. no. 1307, pp. 1 - 11
Karabourniotis G., Liakopoulos G., Nikolopoulos D., Bresta P. Protective and defensive roles of non-glandular trichomes against multiple stresses: structure–function coordination (2020) Journal of Forestry Research, 31 (1)
Giannopoulos A., Nikolopoulos D., Bresta P., Samantas A., Reppa C., Karaboiki K., Dotsika E., Fasseas C., Liakopoulos G., Karabourniotis G. Cystoliths of Parietaria judaica can serve as an internal source of CO2 for photosynthetic assimilation when stomata are closed (2019) Journal of Experimental Botany, 70 (20), pp. 5753 - 5763
Clemente-Moreno M.J., Gago J., Díaz-Vivancos P., Bernal A., Miedes E., Bresta P., Liakopoulos G., Fernie A.R., Hernández J.A., Flexas J. The apoplastic antioxidant system and altered cell wall dynamics influence mesophyll conductance and the rate of photosynthesis (2019) Plant Journal, 99 (6), pp. 1031 - 1046
Giannopoulos A., Bresta P., Nikolopoulos D., Liakopoulos G., Fasseas C., Karabourniotis G.Changes in the properties of calcium-carbon inclusions during leaf development and their possible relationship with leaf functional maturation in three inclusion-bearing species (2019) Protoplasma, 256 (2), pp. 349 - 358
Korgiopoulou C., Bresta P., Nikolopoulos D., Karabourniotis G. Sex-specific structural and functional leaf traits and sun-shade acclimation in the dioecious tree Pistacia vera (Anacardiaceae) (2019) Functional Plant Biology, 46 (7), pp. 649 - 659
Bresta P., Nikolopoulos D., Stavroulaki V., Vahamidis P., Economou G., Karabourniotis G. How does long-term drought acclimation modify structure-function relationships? A quantitative approach to leaf phenotypic plasticity of barley (2018) Functional Plant Biology, 45 (12), pp. 1181 - 1194
Karabourniotis G., Liakopoulos G., Nikolopoulos D., Bresta P., Stavroulaki V., Sumbele S. "Carbon gain vs. water saving, growth vs. defence": Two dilemmas with soluble phenolics as a joker (2014) Plant Science, 227, pp. 21 - 27
Tooulakou G., Giannopoulos A., Nikolopoulos D., Bresta P., Dotsika E., Orkoula M.G., Kontoyannis C.G., Fasseas C., Liakopoulos G., Klapa M.I., Karabourniotis G. Alarm photosynthesis: Calcium oxalate crystals as an internal CO2 source in plants (2016) Plant Physiology, 171 (4), pp. 2577 - 2585
Tooulakou G., Giannopoulos A., Nikolopoulos D., Bresta P., Dotsika E., Orkoula M.G., Kontoyannis C.G., Fasseas C., Liakopoulos G., Klapa M.I., Karabourniotis G. Reevaluation of the plant "gemstones": Calcium oxalate crystals sustain photosynthesis under drought conditions (2016) Plant signaling & behavior, 11 (9), pp. e1215793
Bresta P., Nikolopoulos D., Economou G., Vahamidis P., Lyra D., Karamanos A., Karabourniotis G. Modification of water entry (xylem vessels) and water exit (stomata) orchestrates long term drought acclimation of wheat leaves (2011) Plant and Soil, 347 (1), pp. 179 - 193
Εργαστήριο Συστηματικής Βοτανικής
Σκοπός του Εργαστηρίου Συστηματικής Βοτανικής είναι η παροχή εκπαιδευτικού και ερευνητικού έργου στο Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών (Γ.Π.Α.), στα σχετικά αντικείμενα της Συστηματικής Βοτανικής. Το Εργαστήριο συνεργάζεται με άλλα Εργαστήρια του Γ.Π.Α., με Τμήματα άλλων Πανεπιστημίων καθώς και με υπηρεσίες του Δημοσίου και του Ιδιωτικού φορέα για ερευνητικούς και εκπαιδευτικούς σκοπούς, ενώ παρέχει συμβουλές σε ποικιλία θεμάτων που άπτονται της αρμοδιότητάς του.
Τα κυριότερα αντικείμενα έρευνας των μελών ΔΕΠ και των μεταπτυχιακών φοιτητών του Εργαστηρίου είναι τα ακόλουθα:
Μελέτη της χλωρίδας της Ελλάδας, με έμφαση στη χλωρίδα νησιωτικών και ορεινών περιοχών. Μελέτη, προστασία και ενίσχυση της αυτοφυούς βλάστησης. Λειμώνες και λειμώνια φυτικά είδη. Ταξινομικές μελέτες γενών της Ελληνικής χλωρίδας. Μελέτη φυτικών χρωμοσωμάτων για ταξινομικούς σκοπούς και χημειοταξινομική. Φυτική ποικιλότητα σε αντίξοα περιβάλλοντα (σερπεντινικά πετρώματα, κρημνοί, κτλ.) και σχέσεις φυτών με άλλους οργανισμούς. Φαρμακευτικά φυτά και βιοδραστικοί φυτικοί μεταβολίτες.
Τα περισσότερα αντικείμενα των μελετών του Εργαστηρίου σχετίζονται με συμβολές στη χλωρίδα και βλάστηση περιοχών της Ελλάδας, καθώς επίσης και με μέτρα διατήρησης, προστασίας, ανάδειξης ή ήπιας αξιοποίησης φυτικών πόρων.
Προσωπικό
Ερευνητικά Προγράμματα Εργαστηρίου
Δημοσιεύσεις - Συνέδρια Εργαστηρίου
Εργαστήριο Φυσιολογίας & Μορφολογίας Φυτών
Το Εργαστήριο Φυσιολογίας και Μορφολογίας Φυτών ανήκει στον Τομέα Βοτανικής και Μικροβιολογίας. Σκοπός του Εργαστηρίου είναι η εκπαίδευση και έρευνα πάνω στο αντικείμενο της Bιολογίας των Φυτών με έμφαση στη Μορφολογία και Φυσιολογία.
Η εκπαιδευτική δραστηριότητα του Εργαστηρίου περιλαμβάνει προπτυχιακά μαθήματα Λειτουργικής Ανατομίας Φυτών, Φυσιολογίας Φυτών, Φυσιολογίας Καταπονήσεων των Φυτών, Φυσιολογίας Θρέψης Φυτών Μοριακής, Φυσιολογίας Θρέψης Φυτών, Βοτανικής, Βοτανικής (Ανατομία Φυτών –Συστηματική Βοτανική), Εφαρμοσμένης Φυσιολογίας Φυτών-Αναγνώρισης Καταπονήσεων. Προς το παρόν δεν συμμετέχει σε Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών. Ορισμένα μέλη ΔΕΠ δίδουν μεμονωμένα διαλέξεις.
Περίγραμμα ερευνητικών πεδίων του Εργαστηρίου
Η ερευνητική δραστηριότητα των μελών ΔΕΠ του εργαστηρίου εστιάζεται:
Στην επίδραση παραγόντων καταπόνησης στη δομή και λειτουργία των φυτικών οργανισμών σε καλλιεργούμενα φυτά και ζιζάνια. Ιδιαίτερη έμφαση δίδεται στην έλλειψη νερού.
Στη μελέτη των οπτικών ιδιοτήτων φυτικών οργάνων και το ρόλο τους στην αποδοτικότητα της φωτοσύνθεσης.
Στις σχέσεις δομής-λειτουργίας δευτερογενών μεταβολιτών και κυτταρικών εγκλείστων.
Στη μελέτη της κατανομής και αναδιανομής των ανοργάνων θρεπτικών στοιχείων σε φυτά καλλιεργούμενα στον αγρό.
Διερεύνηση των μηχανισμοί απορρόφησης και ομοιόστασης ανοργάνων θρεπτικών από τα φυτά. Ο ρόλος των συμβιωτικών σχέσεων με μυκορριζικούς μύκητες στους μηχανισμούς αυτούς. Διερεύνηση της ύπαρξης νέων, αχαρακτήριστων μοριακών εξαρτημάτων της ομοιόστασης θρεπτικών στα φυτά.
Οι μελέτες αυτές γίνονται σε όλα τα επίπεδα, από το μορφολογικό και το ανατομικό μέχρι το βιοχημικό και το μοριακό.
Ιστοσελίδες ερευνητικών ομάδων:
Προσωπικό
Ερευνητικά Προγράμματα Εργαστηρίου
Δημοσιεύσεις - Συνέδρια Εργαστηρίου
Sumbele S., Fotelli M.N., Nikolopoulos D., Tooulakou G., Liakoura V., Liakopoulos G., Bresta P., Dotsika E., Adams M.A., Karabourniotis G. Photosynthetic capacity is negatively correlated with the concentration of leaf phenolic compounds across a range of different species (2012) AoB PLANTS, 2012, 2012, pls025
Malounas I., Paliouras G., Nikolopoulos D., Liakopoulos G., Bresta P., Londra P., Katsileros A., Fountas S. Early detection of broccoli drought acclimation/stress in agricultural environments utilizing proximal hyperspectral imaging and AutoML (2024) Smart Agricultural Technology, 8, art. no. 100463
Nikolopoulos D., Bresta P., Daliani V., Haghiou V., Darra N., Liati M., Mavrogianni E., Papanastasiou A., Porfyraki T., Psaroudi V., Karabourniotis G., Liakopoulos G. Leaf anatomy affects optical properties and enhances photosynthetic performance under oblique light (2024) Plant Cell and Environment, 47 (5), pp. 1471 - 1485
Kolyva F., Nikolopoulos D., Bresta P., Liakopoulos G., Karabourniotis G., Rhizopoulou S. Acclimation of the Grapevine Vitis vinifera L. cv. Assyrtiko to Water Deficit: Coordination of Structural and Functional Leaf Traits and the Dynamic of Calcium Oxalate Crystals (2023) Plants, 12 (23), art. no. 3992
Vahamidis P., Stefopoulou A., Kotoulas V., Bresta P., Nikolopoulos D., Karabourniotis G., Mantonanakis G., Vlachos C., Dercas N., Economou G. Grain size variation in two-rowed malt barley under Mediterranean conditions: Phenotypic plasticity and relevant trade-offs (2022) Field Crops Research, 279, art. no. 108454
Roig-Oliver M., Bresta P., Nikolopoulos D., Bota J., Flexas J. Dynamic changes in cell wall composition of mature sunflower leaves under distinct water regimes affect photosynthesis (2021) Journal of Experimental Botany, 72 (22), pp. 7863 - 7875
Karabourniotis G., Liakopoulos G., Bresta P., Nikolopoulos D. The optical properties of leaf structural elements and their contribution to photosynthetic performance and photoprotection (2021) Plants, 10 (7), art. no. 1455
Roig-Oliver M., Bresta P., Nadal M., Liakopoulos G., Nikolopoulos D., Karabourniotis G., Bota J., Flexas J. Cell wall composition and thickness affect mesophyll conductance to CO2diffusion in Helianthus annuus under water deprivation (2020) Journal of Experimental Botany, 71 (22), pp. 7198 - 7209
Karabourniotis G., Horner H.T., Bresta P., Nikolopoulos D., Liakopoulos G. New insights into the functions of carbon–calcium inclusions in plants (2020) New Phytologist, 228 (3), pp. 845 - 854
Gómez-Espinoza O., González-Ramírez D., Bresta P., Karabourniotis G., Bravo L.A. Decomposition of calcium oxalate crystals in colobanthus quitensis under CO2 limiting conditions (2020) Plants, 9 (10), art. no. 1307, pp. 1 - 11
Karabourniotis G., Liakopoulos G., Nikolopoulos D., Bresta P. Protective and defensive roles of non-glandular trichomes against multiple stresses: structure–function coordination (2020) Journal of Forestry Research, 31 (1)
Giannopoulos A., Nikolopoulos D., Bresta P., Samantas A., Reppa C., Karaboiki K., Dotsika E., Fasseas C., Liakopoulos G., Karabourniotis G. Cystoliths of Parietaria judaica can serve as an internal source of CO2 for photosynthetic assimilation when stomata are closed (2019) Journal of Experimental Botany, 70 (20), pp. 5753 - 5763
Clemente-Moreno M.J., Gago J., Díaz-Vivancos P., Bernal A., Miedes E., Bresta P., Liakopoulos G., Fernie A.R., Hernández J.A., Flexas J. The apoplastic antioxidant system and altered cell wall dynamics influence mesophyll conductance and the rate of photosynthesis (2019) Plant Journal, 99 (6), pp. 1031 - 1046
Giannopoulos A., Bresta P., Nikolopoulos D., Liakopoulos G., Fasseas C., Karabourniotis G.Changes in the properties of calcium-carbon inclusions during leaf development and their possible relationship with leaf functional maturation in three inclusion-bearing species (2019) Protoplasma, 256 (2), pp. 349 - 358
Korgiopoulou C., Bresta P., Nikolopoulos D., Karabourniotis G. Sex-specific structural and functional leaf traits and sun-shade acclimation in the dioecious tree Pistacia vera (Anacardiaceae) (2019) Functional Plant Biology, 46 (7), pp. 649 - 659
Bresta P., Nikolopoulos D., Stavroulaki V., Vahamidis P., Economou G., Karabourniotis G. How does long-term drought acclimation modify structure-function relationships? A quantitative approach to leaf phenotypic plasticity of barley (2018) Functional Plant Biology, 45 (12), pp. 1181 - 1194
Karabourniotis G., Liakopoulos G., Nikolopoulos D., Bresta P., Stavroulaki V., Sumbele S. "Carbon gain vs. water saving, growth vs. defence": Two dilemmas with soluble phenolics as a joker (2014) Plant Science, 227, pp. 21 - 27
Tooulakou G., Giannopoulos A., Nikolopoulos D., Bresta P., Dotsika E., Orkoula M.G., Kontoyannis C.G., Fasseas C., Liakopoulos G., Klapa M.I., Karabourniotis G. Alarm photosynthesis: Calcium oxalate crystals as an internal CO2 source in plants (2016) Plant Physiology, 171 (4), pp. 2577 - 2585
Tooulakou G., Giannopoulos A., Nikolopoulos D., Bresta P., Dotsika E., Orkoula M.G., Kontoyannis C.G., Fasseas C., Liakopoulos G., Klapa M.I., Karabourniotis G. Reevaluation of the plant "gemstones": Calcium oxalate crystals sustain photosynthesis under drought conditions (2016) Plant signaling & behavior, 11 (9), pp. e1215793
Bresta P., Nikolopoulos D., Economou G., Vahamidis P., Lyra D., Karamanos A., Karabourniotis G. Modification of water entry (xylem vessels) and water exit (stomata) orchestrates long term drought acclimation of wheat leaves (2011) Plant and Soil, 347 (1), pp. 179 - 193
Karabourniotis, G., Horner, H.T., Bresta, P., Nikolopoulos, D., Liakopoulos, G. New insights into the functions of carbon–calcium inclusions in plants (2020) New Phytologist, 228 (3), pp. 845-854.
Roig-Oliver, M., Bresta, P., Nadal, M., Liakopoulos, G., Nikolopoulos, D., Karabourniotis, G., Bota, J., Flexas, J. Cell wall composition and thickness affect mesophyll conductance to CO2 diffusion in Helianthus annuus under water deprivation (2020) Journal of Experimental Botany, 71 (22), pp. 7198-7209.
Karabourniotis, G., Liakopoulos, G., Bresta, P., Nikolopoulos, D. The optical properties of leaf structural elements and their contribution to photosynthetic performance and photoprotection (2021) Plants, 10 (7), art. no. 1455.