Η Πρώτη ενότητα του μαθήματος είναι αφιερωμένη σε αβιοτικούς παράγοντες καταπόνησης, οι οποίοι από πλευράς σημαντικότητας και επίδρασεων στις αποδόσεις των καλλιεργειών αποκτούν προτεραιότητα. Εξετάζονται οι επιπτώσεις τους στη δομή και λειτουργία των φυτικών οργανισμών, με έμφαση στα καλλιεργούμενα είδη, και οι μηχανισμοί μέσω των οποίων τα φυτά αντεπεξέρχονται τις αντίξοες συνθήκες. Η γνώση των μηχανισμών αυτών αποτελεί προϋπόθεση όχι μόνο για μια σειρά καλλιεργητικών παρεμβάσεων, αλλά και για μελέτες βελτίωσης ή για βιοτεχνολογικές εφαρμογές. Στη Δεύτερη ενότητα εξετάζονται οι ανθρωπογενείς παράγοντες κατάπόνησης έτσι ώστε να δημιουργηθεί ένα υπόβαθρο γνώσεων σχετικά με τις επιπτώσεις των ανθρωπογενών δραστηριοτήτων και των αλλαγών που επιφέρουν στη χλωρίδα και στις καλλιέργειες του πλανήτη (και ως εκ τούτου και στην επιβίωση του ανθρώπινου είδους). Η απόκτηση του υποβάθρου αυτού επιτρέπει την αξιοποίηση των φυτικών οργανισμών από γνώστες που σέβονται τον πλανήτη που τους φιλοξενεί. Στην Τρίτη ενότητα εξετάζονται οι βιοτικοί παράγοντες καταπόνησης, οι επιπτώσεις τους στη δομή και λειτουργία των φυτικών οργανισμών και οι μηχανισμοί μέσω των οποίων τα φυτά αμύνονται. Ιδιαίτερη μνεία γίνεται στους δευτερογενείς μεταβολίτες, τα μόρια τα οποία παίζουν σημαντικό ρόλο στην αντιμετώπιση των βιοτικών παραγόντων καταπόνησης και στη συνέχεια εξετάζονται η προϋπάρχουσα και η επαγώμενη άμυνα. Η γνώση των αμυντικών μηχανισμών αποτελεί προϋπόθεση όχι μόνο για τη κατανόηση των μαθημάτων της Φυτοπαθολογίας και της Φαρμακολογίας, αλλά και για μια σειρά εφαρμογών όπως της παραγωγής βιολογικά δραστικών ουσιών, φαρμάκων και καλλυντικών. Στη Τρίτη ενότητα γίνεται μια προσπάθεια παρουσίασης των συνεπειών της συνύπαρξης περισσότερων του ενός παραγόντων καταπόνησης στη δομή και λειτουργία των φυτικών ειδών καθώς και των αντίστοιχων αντιδράσεών τους, επειδή οι συνθήκες που διαμορφώνονται προσομοιάζουν πλέον με τις ρεαλιστικές συνθήκες πεδίου και αγρού. Τέλος αναπτύσσονται ορισμένες απόψεις σχετικά με τις υπάρχουσες αλλά και τις πιθανές βιοτεχνολογικές εφαρμογές που βασίζονται στις γνώσεις υποβάθρου που αποκτήθηκαν.